Mayo Clinic Proceedings[IF:7.199]
① 纳入26名超重和肥胖受试者，用基于营养、运动和行为的生活方式综合干预进行减肥，持续3个月；② 9名受试者减重≥5%（成功，平均减掉7.89kg），17名减重<5%（失败，平均减掉1.51kg）；③ 减肥成功与失败者干预前的临床特征和肠道菌群多样性相似，菌群组成和多样性在干预后也未显著改变；④ 然而，干预前考拉杆菌属丰度高与减肥成功显著相关，戴阿利斯特杆菌属丰度高、菌群的碳水化合物代谢能力强，均与减肥失败相关。
Gut Microbial Carbohydrate Metabolism Hinders Weight Loss in Overweight Adults Undergoing Lifestyle Intervention With a Volumetric Diet
08-01 DOI: 10.1016/j.mayocp.2018.02.019
Gut[IF:17.016]
① 纳入3882名受试者，其中1337名（34%）为非酒精性脂肪性肝病（NAFLD）患者；② 在校正社会人口统计学数据及生活方式协变量后，饮食中摄入的蛋白质与超重者的NAFLD相关，相关性来自于动物蛋白的摄入；③ 校正代谢协变量后，仅有动物蛋白的摄入与超重者的NAFLD相关；④ 摄入单糖与二糖与较低的总体NAFLD发病率相关，但在校正代谢协变量及BMI后，这种相关性不再存在；⑤ 摄入的脂肪类型或摄入的纤维与NAFLD无显著关联。
Association of dietary macronutrient composition and non-alcoholic fatty liver disease in an ageing population: the Rotterdam Study
07-31 DOI: 10.1136/gutjnl-2017-315940
Molecular Pharmaceutics[IF:4.556]
① 甘草酸二铵（DG）降低了高脂饮食诱导的非酒精性脂肪肝病（NAFLD）小鼠的体重、肝脏脂肪变性及肝脏炎症；② DG干预显著改变了NAFLD小鼠的肠道菌群组成，增加了菌群丰富度；③ DG降低厚壁菌门/拟杆菌门的比值，减少了内毒素产生菌，提高了乳酸杆菌属等益生菌的丰度；④ DG可增加短链脂肪酸（SCFA）产生菌，促进SCFA生成;⑤ DG还显著减轻肠道低度炎症，改善紧密连接蛋白的表达、杯状细胞数量和黏液分泌，从而增强肠道屏障功能。
Diammonium Glycyrrhizinate Protects against Non-Alcoholic Fatty Liver Disease in mice through modulation of gut microbiota and restoring intestinal barrier
07-23 DOI: 10.1021/acs.molpharmaceut.8b00347
Clinical Microbiology Reviews[IF:20.642]
① 肠杆菌科变形菌属是肠道共生菌，可引起尿路感染，但在肠道菌群中丰度很低（<0.05%），在数据处理中往往被忽略；② 变形菌属可产生与胃肠道疾病相关的毒力因子，致病能力与运动性、粘附性、脲酶/溶血素/IgA蛋白酶的产生、获得抗生素耐药性的能力等相关；③ 变形菌属在消化道不同位置的丰度不同，与其有关的消化道疾病包括肠胃炎、肝胆和胰腺疾病、阑尾炎、医院内感染等，与克罗恩病的关联尤为密切；④ 变形菌属是致病共生菌，需深入研究。
Proteus spp. as Putative Gastrointestinal Pathogens
07-01 DOI: 10.1128/CMR.00085-17
ISME Journal[IF:9.52]
① 北美河狸以木本植物作为筑坝原料和主要食物，但缺乏相关肠道菌群信息；② 联合宏基因组学、功能筛选和碳水化合物生物化学绘制河狸粪便菌群的群落结构和代谢能力，并分析分布在群体基因组间的糖苷水解酶(GH)家族的功能；③ 发现了包括GH43酶和多种多糖利用位点为代表的木聚糖寡聚体降解新机制，菌群可能存在物质降解的协同作用；④ 通过该适应性，河狸菌群能有效将木本植物转化为营养；⑤ 该木质降解原理有利于生物精炼过程中酶制剂的设计优化。
Metagenomics reveals functional synergy and novel polysaccharide utilization loci in the Castor canadensis fecal microbiome
07-16 DOI: 10.1038/s41396-018-0215-9
Scientific Reports[IF:4.122]
① 选取441名哥伦比亚成年人进行横断面研究，分析肠道菌群与人口统计学、健康相关指标、饮食之间的关联；② 在哥伦比亚人群的肠道菌群中，富集了采集狩猎者特有的普氏菌属及密螺旋体属，以及工业化社会居民特有的拟杆菌属、双歧杆菌属、Barnesiella菌属；③ 这些分类群在哥伦比亚人群肠道菌群中的相对丰度与采集狩猎者及西方人群均不同；④ 鉴定出与生活方式、肥胖、心血管代谢疾病相关的特定菌群，以及可解释菌群与宿主健康关联的代谢通路。
Gut microbiota is associated with obesity and cardiometabolic disease in a population in the midst of Westernization
07-27 DOI: 10.1038/s41598-018-29687-x
Nature Ecology & Evolution[IF:N/A]
① 单菌种对抗生素的剂量反应，无法准确预测治疗过程中或停药后的菌群动态；② 建立了“剂量-反应镶嵌模式”这一概念，利用耐药光滑念珠菌和敏感白色念珠菌制成合成菌群，研究两个种群在不同抗生素剂量和养分条件下的丰度变化；③ 菌群结构随抗生素浓度及养分条件的改变而发生变化，并在特定条件下形成结构转折点；④ 当菌群结构超过转折点，菌群的耐药性不可逆转，停药后耐药菌株丰度依然会增加。
Drug-mediated metabolic tipping between antibiotic resistant states in a mixed-species community
07-09 DOI: 10.1038/s41559-018-0582-7
Nature Microbiology[IF:14.174]
① 从拟南芥叶际分离出224株菌株，鉴定出超过一千个预测的天然产物生物合成基因簇（BGC），其中有数百个是之前未知的；② 通过高通量筛选对这些菌株之间超过5万对的两两互作进行分析，发现了26个菌株主要参与的725个抑制性互作；③ 其中，短芽孢杆菌属sp. Leaf182菌株的抑制效应最强；④ 通过基于基因组挖掘的策略，分离出一种反式酰基转移酶聚酮合酶衍生抗生素——macrobrevin。
Bipartite interactions, antibiotic production and biosynthetic potential of the Arabidopsis leaf microbiome
08-01 DOI: 10.1038/s41564-018-0200-0
